MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 11717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015184	GCATCC	3	18	590094	590111	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325168922
11502	NC_015184	GCGTCG	2	12	590136	590147	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325168922
11503	NC_015184	GCATCC	2	12	590212	590223	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325168922
11504	NC_015184	GCATCG	2	12	590282	590293	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_015184	TCGGCA	2	12	590321	590332	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_015184	CAG	2	6	590346	590351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_015184	GCATCG	2	12	590355	590366	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_015184	TCGGCA	2	12	590394	590405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_015184	TCAGCG	2	12	590494	590505	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325168923
11510	NC_015184	CGTCAG	3	18	590522	590539	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325168923
11511	NC_015184	GCATCG	3	18	590557	590574	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325168923
11512	NC_015184	TCGGCA	2	12	590620	590631	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325168923
11513	NC_015184	GCATCC	3	18	590689	590706	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325168923
11514	NC_015184	GCGTCA	2	12	590707	590718	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325168923
11515	NC_015184	GCATCC	3	18	590839	590856	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325168923
11516	NC_015184	TCC	2	6	590916	590921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168923
11517	NC_015184	GCCA	2	8	590940	590947	25 %	0 %	25 %	50 %	325168923
11518	NC_015184	GCG	2	6	590992	590997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168923
11519	NC_015184	CCAG	2	8	591065	591072	25 %	0 %	25 %	50 %	325168923
11520	NC_015184	TCC	2	6	591088	591093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168923
11521	NC_015184	CCAT	2	8	591115	591122	25 %	25 %	0 %	50 %	325168923
11522	NC_015184	GAA	2	6	591170	591175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168923
11523	NC_015184	CG	3	6	591222	591227	0 %	0 %	50 %	50 %	325168923
11524	NC_015184	ACC	2	6	591285	591290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168923
11525	NC_015184	GGC	2	6	591291	591296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168923
11526	NC_015184	TCC	2	6	591328	591333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11527	NC_015184	GCC	2	6	591367	591372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11528	NC_015184	CGA	2	6	591414	591419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_015184	AAGC	2	8	591428	591435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11530	NC_015184	AAC	2	6	591445	591450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_015184	A	6	6	591515	591520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_015184	A	7	7	591534	591540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_015184	AT	3	6	591593	591598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_015184	TA	3	6	591611	591616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_015184	ATC	2	6	591673	591678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_015184	GCG	2	6	591741	591746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_015184	GA	3	6	591796	591801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_015184	A	6	6	591814	591819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_015184	AT	3	6	591834	591839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_015184	GGCC	2	8	591850	591857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11541	NC_015184	GGC	2	6	591998	592003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168924
11542	NC_015184	TGAC	2	8	592100	592107	25 %	25 %	25 %	25 %	325168924
11543	NC_015184	GAGC	2	8	592115	592122	25 %	0 %	50 %	25 %	325168924
11544	NC_015184	CTTT	2	8	592131	592138	0 %	75 %	0 %	25 %	325168924
11545	NC_015184	ACT	2	6	592151	592156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168924
11546	NC_015184	CAAC	2	8	592183	592190	50 %	0 %	0 %	50 %	325168924
11547	NC_015184	GC	4	8	592191	592198	0 %	0 %	50 %	50 %	325168924
11548	NC_015184	TCG	2	6	592252	592257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168924
11549	NC_015184	CGC	2	6	592406	592411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168924
11550	NC_015184	CTGC	2	8	592426	592433	0 %	25 %	25 %	50 %	325168924
11551	NC_015184	CG	3	6	592447	592452	0 %	0 %	50 %	50 %	325168924
11552	NC_015184	GT	3	6	592501	592506	0 %	50 %	50 %	0 %	325168924
11553	NC_015184	CAA	2	6	592586	592591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168924
11554	NC_015184	CGG	2	6	592600	592605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168924
11555	NC_015184	GCA	2	6	592627	592632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168924
11556	NC_015184	CG	3	6	592771	592776	0 %	0 %	50 %	50 %	325168924
11557	NC_015184	CAT	2	6	592793	592798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168924
11558	NC_015184	CGATC	2	10	592911	592920	20 %	20 %	20 %	40 %	325168924
11559	NC_015184	CTG	2	6	593000	593005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168924
11560	NC_015184	CAG	2	6	593062	593067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168924
11561	NC_015184	GTTCG	2	10	593092	593101	0 %	40 %	40 %	20 %	325168924
11562	NC_015184	CAAA	2	8	593277	593284	75 %	0 %	0 %	25 %	325168924
11563	NC_015184	GAA	2	6	593331	593336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_015184	AAT	2	6	593452	593457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_015184	TGC	2	6	593514	593519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_015184	G	7	7	593541	593547	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_015184	GTGC	2	8	593606	593613	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11568	NC_015184	GTT	2	6	593640	593645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_015184	CGT	2	6	593669	593674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_015184	CCTGA	2	10	593737	593746	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11571	NC_015184	TGCG	2	8	593868	593875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11572	NC_015184	AG	3	6	593947	593952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_015184	A	6	6	594140	594145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_015184	AACTCA	2	12	594165	594176	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_015184	CCT	2	6	594252	594257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11576	NC_015184	ACG	2	6	594280	594285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_015184	GC	3	6	594320	594325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11578	NC_015184	GCCG	2	8	594494	594501	0 %	0 %	50 %	50 %	325168925
11579	NC_015184	CGG	2	6	594505	594510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168925
11580	NC_015184	AGAA	2	8	594627	594634	75 %	0 %	25 %	0 %	325168925
11581	NC_015184	GAG	2	6	594653	594658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168925
11582	NC_015184	CAGAT	2	10	594765	594774	40 %	20 %	20 %	20 %	325168925
11583	NC_015184	ACG	2	6	594795	594800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168925
11584	NC_015184	GAT	2	6	594816	594821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168925
11585	NC_015184	GCG	4	12	594846	594857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168925
11586	NC_015184	GC	3	6	594929	594934	0 %	0 %	50 %	50 %	325168925
11587	NC_015184	GAA	3	9	594935	594943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168925
11588	NC_015184	GCA	2	6	594965	594970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_015184	TTG	2	6	595001	595006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_015184	T	6	6	595044	595049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_015184	GCG	2	6	595069	595074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_015184	T	6	6	595098	595103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_015184	GTCTCA	2	12	595161	595172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_015184	CGG	3	9	595194	595202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11595	NC_015184	AGC	2	6	595313	595318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168926
11596	NC_015184	GTA	2	6	595366	595371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168926
11597	NC_015184	CCA	2	6	595430	595435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168926
11598	NC_015184	TCG	2	6	595517	595522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168926
11599	NC_015184	GC	3	6	595541	595546	0 %	0 %	50 %	50 %	325168926
11600	NC_015184	GCC	2	6	595565	595570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168926
11601	NC_015184	CG	3	6	595620	595625	0 %	0 %	50 %	50 %	325168926
11602	NC_015184	GC	3	6	595640	595645	0 %	0 %	50 %	50 %	325168926
11603	NC_015184	ACG	2	6	595757	595762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168926
11604	NC_015184	GC	3	6	595797	595802	0 %	0 %	50 %	50 %	325168926
11605	NC_015184	ACC	2	6	595813	595818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168926
11606	NC_015184	CAC	2	6	595825	595830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168926
11607	NC_015184	GCA	2	6	595835	595840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168926
11608	NC_015184	CTC	2	6	595879	595884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168926
11609	NC_015184	AGC	2	6	595886	595891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168926
11610	NC_015184	ACG	2	6	595982	595987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168926
11611	NC_015184	GCT	2	6	596000	596005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168926
11612	NC_015184	CAT	2	6	596019	596024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168926
11613	NC_015184	GAT	2	6	596178	596183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168926
11614	NC_015184	AGCG	2	8	596222	596229	25 %	0 %	50 %	25 %	325168926
11615	NC_015184	CGG	2	6	596248	596253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168926
11616	NC_015184	GCCGC	2	10	596281	596290	0 %	0 %	40 %	60 %	325168926
11617	NC_015184	GAT	2	6	596332	596337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168926
11618	NC_015184	TCAA	2	8	596379	596386	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11619	NC_015184	GCTG	2	8	596432	596439	0 %	25 %	50 %	25 %	325168927
11620	NC_015184	CCG	2	6	596508	596513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168927
11621	NC_015184	GA	3	6	596514	596519	50 %	0 %	50 %	0 %	325168927
11622	NC_015184	GCC	3	9	596588	596596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168927
11623	NC_015184	CAT	2	6	596611	596616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168927
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11711	NC_015184	CGAT	2	8	601194	601201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11712	NC_015184	TAT	2	6	601212	601217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11713	NC_015184	GTC	2	6	601240	601245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11714	NC_015184	T	6	6	601348	601353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11715	NC_015184	CGAC	2	8	601372	601379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11716	NC_015184	TGA	2	6	601382	601387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11717	NC_015184	GCC	2	6	601476	601481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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